Det finns inget sådant "Purgeverktyg" inbyggt men det borde gå att lösa ganska enkelt med t.ex. PowerShell.
Hur ser inställningarna ut för versionshantering idag? Hur många versioner sparar ni, Major Minor inställningar?
Skulle du ändra inställningarna på ett bibliotek till att enbart spara sista så kommer SP ta bort de äldre versionerna men jag gissar att ni har en hel del arkiv?